降雨之后，根据对蔬菜造成影响程度的不同，管理方式也要做相应的调整。菜农应及早采取措施，如有棚内积水，则要在短时间内将积水排出棚外，调整植株长势，做好病害的预防工作，确保蔬菜在短时间内恢复正常生长。
雨水进棚时间短，对蔬菜的影响较小。降雨过后，菜农应及时跟进管理，确保蔬菜快速复壮，恢复正常生产。
降雨过程中，为减少雨水进棚，风口及前脸处是关闭的。但降雨过后，菜农应及早通风，将前脸薄膜及顶部风口大敞开，快速排出棚内湿气，并连续多日。需要注意的是，风口的防虫网要安装、检查好，避免害虫趁虚而入。雨水如进棚，会导致土壤湿度大增，土壤中空气含量降低，易滋生有害菌，使根系呼吸困难且易感染病害。因此，当棚内积水下降后，在浇清水或冲施微生物菌剂后，菜农应及时进行划锄，打破郁闭的地表并降低地温。对于铺设地膜的棚室，应将地膜揭开，适度进行划锄。若蔬菜处于生长前期，根系伸展范围小，操作行内可进行深划锄，植株附近浅划锄。若蔬菜已经进入结果期，则可以只划锄种植行内。对于地下水位高，存在反复返水的棚室，在浇水时，菜农应认真查看地下水位及土壤湿度情况，再合理安排浇水。尤其是苗期蔬菜，过旱或过涝均不利于其正常生长。
雨水如进入大棚，土壤湿度大增，在植株自身重量、大风等综合影响下，不仅根系生长受抑制，植株自身也会倾斜甚至歪倒，尤其是处于苗期的蔬菜受害更严重些。对此，菜农应及时做好植株的清理及调整工作。清水冲刷茎叶。棚内积水排出后，蔬菜上难免会有泥点，尤其是未吊起、小苗期的蔬菜上则更多，有的叶片还压在淤泥中，让原本叶片就不多的植株长势变弱。菜农应及早喷洒清水，将叶片及茎秆上的泥点冲刷掉，尽可能保护好功能型叶片，以增加有效光合叶面积。同时，对于已经满足生长高度的植株应及时吊蔓，如番茄，为避免其徒长，可以将茎秆倾斜吊起。根系受损，对植株长势影响较大，甚至有不少植株生长势弱或生长点消失。若雨水排出后，对于长势难恢复的弱苗应及早更换新苗，对于长势尚可，生长点消失的植株，可以摘除原有的生长点，重新留取侧枝作为新的生长点。摘心换头的操作在一定程度上还具有抑制徒长的作用。此外，若植株底部叶片受损严重的，菜农应及早疏除，避免其在高温高湿环境中，成为致病菌的侵染源。
